L'Empire mongol (元朝、げんちょう；蒙古帝国、もうこていこく) est la faction antagoniste de Ghost of Tsushima.
En 1274, les Mongols envahissent l'île de Tsushima sous le commandement de Khotun Khan, cousin de Kubilai Khan. Les samouraïs de l'île, dont Jin Sakai, essuient une terrible défaite lors de la bataille de la plage de Komoda. Seuls le Seigneur Shimura - capturé par le Khan - et Jin survivent.